Обнаружил интереснейший эффект:
MySQL Query Browser version 1.1.2 как то странно понимает пробел в начале первой строки запроса.
У меня сложилось впечатление, что он его понимает как комментарий всего запроса. И, соответственно, его не выполняет. Причем в статусной строке пишет ‘Query returned no resultset’.
Достаточно неприятный сюрпризец был.